Pré-aqueça o forno a 200 graus e forre uma assadeira com papel manteiga.
Tempere o frango dos dois lados com sal.
Coloque a farinha, o pão, o orégano, o alho e as pimentas em um saco plástico.
Coloque as coxas de frango no saco e cubra com a mistura de farinha.
Coloque as coxinhas empanadas no forno por 15 a 20 minutos, até que estejam douradas.
Enquanto o frango estiver cozinhando, faça o molho de tomate.
Coloque o azeite em uma frigideira média e aqueça em fogo médio. Adicione a cebola e uma pitada de sal, cozinhe as cebolas até ficarem translúcidas.
Adicione o alho e manjericão e cozinhe por mais alguns minutos. Adicione o orégano e a passata e cozinhe por mais 5 minutos, até que o molho tenha reduzido e engrossado.
Retire as coxinhas de frango do forno, coloque em uma travessa. Despeje o molho de tomate ao redor do frango, em seguida, espalhe o queijo parmesão e muçarela por cima.
Retorne ao forno e asse por mais 10-15 minutos até que o queijo esteja derretido.